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JoVE Journal
Genetics

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JoVE Journal Genetics
Sélection assistée de biomarqueurs par taille d’effet d’analyse discriminante linéaire (LEfSe) dans les données du microbiome
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Sélection assistée de biomarqueurs par taille d’effet d’analyse discriminante linéaire (LEfSe) dans les données du microbiome

Article DOI: 10.3791/61715-v • 04:57 min • May 16th, 2022
May 16th, 2022 •
*1, *2, 3
1Marine Resources Research Centre, Tianjin Research Institute for Water Transport Engineering, M.O.T., 2Key Laboratory of Regional Energy Systems Optimization, Ministry of Education, College of Environmental Science and Engineering, North China Electric Power University, 3School of Environmental Science and Engineering, Huazhong University of Science and Technology
* These authors contributed equally

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LEfSe (LDA Effect Size) est un outil d’exploration de biomarqueurs de haute dimension pour identifier les caractéristiques génomiques (telles que les gènes, les voies et les taxonomies) qui caractérisent de manière significative deux groupes ou plus dans les données du microbiome.

Tags

Génétique Numéro 183 LEfSe Biomarqueur Génome Biodiversité Différence statistique Corrélation biologique
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